Kematian adalah salah satu dari banyak misteri yang membuat umat manusia berada dalam kegelapan sejak awal waktu. Namun, pertanyaan membara tentang apa yang terjadi pada jiwa setelah seseorang meninggal segera terjawab oleh Yuzuru Otonashi yang berusia 17 tahun. Terbangun tanpa kenangan sebelumnya dalam dimensi antara hidup dan mati, ia menemukan kebenaran yang meresahkan tentang akhirat.
Berbentuk sekolah menengah atas, dimensi aneh ini ditujukan untuk melindungi mereka yang meninggal karena kematian yang tidak diinginkan. Merasa diperlakukan tidak adil oleh Tuhan selama kehidupan mereka di dunia, para penghuni sekolah memutuskan untuk membentuk Afterlife Battlefront—sebuah faksi pemberontak yang bertekad menentang ketua OSIS mereka yang bagaikan dewa, Kanade "Angel" Tachibana. Pemimpin kelompok tersebut, Yuri Nakamura, merekrut Otonashi dalam pertarungan mereka melawan Angel untuk mengambil kendali atas hidup mereka sendiri. Namun, mempertanyakan moralitas di balik tindakan mereka, Otonashi mengambil langkah di belakang garis musuh untuk memahami sisi berlawanan dari nasib bersama mereka.