Chiyo Mihama memulai karir sekolah menengahnya sebagai salah satu siswa teraneh di kelas pertamanya—seorang anak ajaib akademis berusia 10 tahun yang menyukai boneka mewah dan masakan buatan sendiri. Tapi wali kelasnya, Yukari Tanizaki, adalah tipe orang yang akan membajak sepeda siswanya agar tidak terlambat, jadi "aneh" adalah kata yang relatif.
Tentu saja tidak ada kekurangan gadis aneh di kelas wali kelas Yukari-sensei. Mendampingi Chiyo adalah siswa seperti Tomo Takino, seorang tomboi energik yang lebih antusias daripada otak; Koyomi Mizuhara, sahabat Tomo yang emosinya lebih pendek dari Chiyo; dan Sakaki, seorang wanita cantik tinggi atletis yang penampilannya mengintimidasi menyembunyikan kepribadian lembut dan obsesi menyakitkan terhadap kucing. Selain itu, murid pindahan Ayumu Kasuga, seorang gadis dengan kepala terjebak di awan, cocok dengan gadis-gadis lainnya—dan dia memiliki beberapa teori menarik tentang kuncir Chiyo!
Bersama-sama, sekelompok gadis yang menyenangkan ini mengalami naik turunnya kehidupan sekolah, banyak petualangan mereka yang penuh dengan tawa terus-menerus, absurditas yang nyata, dan kadang-kadang bahkan komentar menyentuh tentang sifat sekolah menengah yang pahit dan sementara.