Siswa kelas lima yang feminin Shuuichi Nitori dianggap oleh sebagian besar orang sebagai salah satu gadis tercantik di sekolah, tetapi yang membuatnya kecewa, dia sebenarnya laki-laki secara biologis. Untungnya, Shuuichi memiliki teman masa kecil yang memiliki perasaan tidak nyaman yang sama terkait dengan identitas gender: si tomboi jangkung Yoshino Takatsuki, yang, meskipun secara biologis perempuan, tidak mengidentifikasi dirinya sebagai perempuan. Kedua sahabat ini berbagi rahasia yang sama dan menemukan pelipur lara satu sama lain; namun, kehidupan mereka menjadi lebih rumit ketika mereka harus menapaki perairan yang tidak dikenal di sekolah baru, mencoba mendapatkan teman baru, dan berjuang untuk mempertahankan teman lama. Dihadapkan dengan rintangan yang hampir tidak dapat diatasi, mereka harus belajar untuk menghadapi kenyataan pahit dalam tumbuh dewasa, menjadi transgender, hubungan, dan penerimaan. Dipuji sebagai pandangan yang sangat serius terhadap identitas gender dan perjuangan LGBT, Hourou Musuko karya Takako Shimura berkisah tentang usaha Shuuichi dan Yoshino untuk menemukan jati diri mereka saat memasuki masa pubertas, menjalin pertemanan, jatuh cinta, dan menghadapi beberapa pilihan yang sangat nyata dan sulit.