Pada awal abad ke-21, Institut Penelitian Kurobe Perserikatan Bangsa-Bangsa didirikan di Jepang untuk menyelidiki artefak kuno, yang ditemukan selama pembangunan Bendungan Kurobe. Para ilmuwan dari seluruh dunia berkumpul di fasilitas tersebut untuk mempelajari objek tersebut, sementara anak-anak mereka menikmati kehidupan sehari-hari mereka dengan bersekolah di Sekolah Menengah Atas Internasional Mt. Tate.
Yukina Shirahane, seorang gadis SMA yang pendiam, adalah putri dari kepala ilmuwan fasilitas tersebut. Saat mengunjungi ibunya di fasilitas tersebut, Yukina berhasil memecahkan sebagian teka-teki artefak tersebut. Yang mengejutkannya, yang muncul di hadapannya adalah Kennosuke Tokisada Ouma, seorang samurai muda dari era Sengoku.
Saat ancaman mendekat dari luar angkasa, Yukina, bersama dengan Kennosuke, mendapati dirinya mempertahankan Bumi dari pasukan penyerang. Sepanjang perjalanan, dia menemukan misteri di balik Kennosuke dan alasan mengapa dia bertekad untuk melindunginya.
[Ditulis oleh MAL Rewrite]