Magano, alam paralel yang dipenuhi monster yang dikenal sebagai "Kegare," adalah tempat para pengusir setan berurusan dengan semua kotoran. Benio Adashino adalah pengusir setan ajaib yang dikenal karena kekuatannya dan dipanggil ke Tokyo oleh Serikat Pengusir Setan. Dalam perjalanannya, dia jatuh ke pelukan Rokuro Enmadou, seorang pengusir setan muda dengan masa lalu yang bermasalah.
Namun, kotoran Magano tidak tinggal diam. Ketika kedua pengusir setan ini menyaksikan beberapa anak dicuri oleh Kegare, Benio bergegas menyelamatkan mereka, menyeret Rokuro bersamanya ke Magano. Terlibat dalam perkelahian yang hampir membuatnya kalah, Benio diselamatkan oleh Rokuro, menunjukkan dirinya mampu menjadi saingannya dalam hal bakat.
Sousei no Onmyouji menceritakan kisah dua pengusir setan berbakat yang ditakdirkan untuk menjadi "Pengusir Setan Bintang Kembar" dan orang tua Miko yang dinubuatkan—reinkarnasi Abe no Seimei—yang akan membersihkan dunia dari semua kotoran.
[Ditulis oleh MAL Rewrite]
